Están basadas en el análisis de registros fósiles de organismos ya extintos.
Paleontológicas
Relaciona las estructuras y el desarrollo embrionario de los organismos actuales, con los de organismos extintos
Anatomía Comparada
Se basan en la comparación de los componentes químicos de las estructuras de los acidos nucleicos
Embriológicas
Comparan la distribución actual de las especies, con los diferentes cambios y transformaciones que a sufrido su entorno a través del tiempo.
Analizan y comparan las diferentes etapas del desarrollo embrionario de los seres vivos, buscando establecer una relación entre estos.
Biogeográficas
Bioquímicas y genéticas
