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Ensamblaje y Anotación de secuencias

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Avril Lechuga
Avril Lechuga
Mexico

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Ensamblaje y Anotación de secuencias

by Avril Lechuga
1

Formato de archivo de texto que almacena secuencias de nucleótidos junto con la calidad de cada base secuenciada.

2

Proceso general que elimina secuencias contaminantes, artefactos y adaptadores.

3

Fragmentos de ADN obtenidos en secuenciación, almacenados en formato FASTQ.

4

Proceso computacional que une fragmentos cortos de ADN para reconstruir un genoma

5

Estrategia de ensamblaje que no utiliza un genoma de referencia previo

6

Herramienta de ensamblaje que utiliza gráficos de De Bruijn y es excepcional para genomas pequeños

7

Herramienta de ensamblaje ideal para datos de lecturas largas de PacBio y genomas grandes

8

Fase del ensamblaje en la que se organizan los contigs en el orden y orientación más próximo al genoma real

9

Herramienta utilizada para la predicción de genes en procariotas.

10

Fragmentos cortos de ADN que se usan para construir un grafo en el ensamblaje con la estrategia de De Brujin

11

Herramienta de predicción de genes para eucariotas

12

Tipo de anotación que se centra en identificar los elementos físicos del genoma, como genes y ORFs

13

Una de las tres aplicaciones prácticas de la genómica mencionadas en la presentación

14

Métrica que se utiliza para evaluar la calidad de un ensamblaje, que cuanto más alto sea el valor, mejor

15

Proceso que se enfoca en identificar y asignar una función biológica a los elementos del genoma

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