Quiz: CTTN "Cùng vui học tốt" - Quiz 6 (bioinformatics


CTTN "Cùng vui học tốt" - Quiz 6Online version Mỗi tuần một bài trắc nghiệm nhỏ vừa giải trí vừa giúp ôn lại kiến thức cho các bạn sinh viên 18CSH1. Nội dung xoay quanh các môn học trong học kì 2 năm học 2019 - 2020. Bài trắc nghiệm bao gồm tổ hợp các câu hỏi của môn: Thực tập Tin Sinh. by 18180045 Lại Ngọc Phương Thảo 1 NCBI là viết tắt của: a National Center for Biotechnology Information b Nation Center for Biotechnology Information c National Center for Biology Information d Nation Center for Biology Information 2 NCBI là viết tắt của: a Nation Center for Biotechnology Information b Nation Center for Biotechnology Information c National Center for Biology Information d National Center for Biotechnology Information 3 Đâu là cơ sở dữ liệu thuộc NCBI? Choose one or more answers a Bookshelf b OMIM (Online Medelian Inheritance in Man c dbEST (Database of Expressed Sequence Tags) d GermOnLine e Structure (Molecular Modeling Database) f Assembly 4 Đâu là cơ sở dữ liệu thuộc NCBI? Choose one or more answers a BLAST b PROSITE c PopSet Database d Protein Database e Database f ENZYME 5 Đâu là cơ sở dữ liệu thuộc NCBI? Choose one or more answers a HomoloGene b Copernic c dbVar (Database of Genomic Structural Variation) d Entrez e dbSNP (Database of Short Genetic Vairiations) f iCn3D 6 Đâu là trang web giúp ta có thể tra cứu những thông tin về sinh học? Choose one or more answers a http://www.ncbi.nlm.nil.gov/ b http://www.ncbi.nlm.gov/search/ c http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/ d http://www.ebi.ac.uk/ e http://www.ioit-hcm.ac.vn f https://www.ebi.ac.uk/about/news 7 Đâu là trang web có thể giúp ta tra cứu những thông tin về sinh học? Choose one or more answers a https://www.ebi.ac.uk/about b https://en.wikipedia.org/wiki/Main_Page c https://pubmed.ncbi.nlm.nih.go/ d http://www.expasy.org/ e https://www.expasy/structural_bioinformatics f https://www.expasy.org/genomics 8 Đâu là trang web có thể giúp ta tra cứu những thông tin về sinh học? Choose one or more answers a https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html b https://www.epasy.org/ c https://www.ddbj.nig.ac.jp/services-e.html d https://www.rcsb.org/ e http://www.ncbi.nlm.nil.gov/Genbank/ f https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/ 9 Đâu là tên của một ngân hàng dữ liệu sinh học? Choose one or more answers a EMBL-EBI b ExPASy c CMBS d SCOP e Prosite f Pfam 10 Sơ đồ nguyên tắc tìm kiếm thường sử dụng là: a Chọn cách tìm kiếm > Xác định từ khóa > Thông tin cần tìm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm b Xác định từ khóa > Chọn cách tìm kiếm > Thông tin cần tìm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm c Thông tin cần tìm > Xác định từ khóa > Chọn cách tìm kiếm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm d Chọn cách tìm kiếm > Xác định thông tin > Từ khóa cần tìm > Lọc thông tin > Kết quả cần tim 11 Sơ đồ nguyên tắc tìm kiếm thường sử dụng là: a Thông tin cần tìm > Chọn cách tìm kiếm > Xác định kết quả > Lọc thông tin > Kết quả cần tim b Thông tin cần tìm > Xác định thông tin > Chọn cách tìm kiếm > Lọc kết quả > Kết quả cần tìm c Thông tin cần tìm > Xác định thông tin > Chọn trang tìm kiếm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm d Thông tin cần tìm > Xác định từ khóa > Chọn cách tìm kiếm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm 12 Nguyên tắc chung của việc nhập từ khóa là: Choose one or more answers a Để tìm thông tin có nhiều từ khóa ta nhập tuần tự các từ khóa và phân cách giữa các từ bằng khoảng trắng (dùng spacebar). b Để tìm kiếm thông tin có ít từ khóa ta cần nhập tất cả các từ khóa vào trong ô tìm kiếm, phân cách giữa các từ bằng dấu "+". c Để tìm thông tin chứa một cụm từ khóa ta thường đặt chúng trong dấu ngoặc kép (""), các từ ít liên quan (for, of, in, to,...) cũng phải được nhập vào để đảm bảo độ chính xác của kết quả. d Để tìm thông tin chứa một cụm từ khóa ta thường đặt chúng trong dấu ngoặc vuông (""), các từ thường dùng có thể lược bỏ. e Để tìm thông tin chứa một cụm từ khóa ta thường đặt chúng trong dấu ngoặc kép (""), các từ thường dùng (for, of, in, to,...) có thể lược bỏ. 13 "___ là hệ thống tìm kiếm và truy cập chính của NCBI". Điền vào "___" cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, viết hoa chữ cái đầu câu, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 14 Có mấy cách để truy cập vào trang Entrez? Lưu ý: trả lời bằng một số, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 15 "Trong Entrez, bạn có thể tìm kiếm nhiều dạng cơ sở dữ liệu khác nhau. Mỗi cơ sở dữ liệu là một liên kết được biểu thị bằng dòng văn bản màu ___. Các dòng văn bản này sẽ đổi màu khi được chọn". Điền vào "___" cho thích hợp: a vàng b xanh c nâu d đen 16 "___ của công trình trên NCBI, là một dãy số đặc trưng duy nhất cho mỗi bài báo công bố được lưu trữ trên NCBI". Điền vào "___" cho phù hợp. Lưu ý: Lưu ý: viết đúng chính tả, kể cả các chữ viết in hoa, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 17 Để thu hẹp phạm vi tìm kiếm bài báo trên cơ sở dữ liệu PubMed ta có thể dùng: Choose one or more answers a Các mục chức năng phía trái của kết quả tìm kiếm như: Article type, Text avaibility, Publication dates, Species. b Tùy chỉnh kết quả hiển thị thông qua thay đổi định dạng (Format) hoặc thứ tự sắp xếp (Sort by). c Thẻ tag (ví dụ: [AB], [AU], [DP], [CY], [IP], [IS], [LA], [PG], [TI], [VI], [JO]). d Tìm kiếm với từ khóa là cụm từ (phrase). e Sử dụng các toán tử so sánh boolean [AND, OR, NOT]. 18 Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của: a Một bài báo trên PubMed. b Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. c Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. d Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein. e Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein. f Các đáp án trên đều sai. 19 Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của: a Một bài báo trên PubMed. b Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. c Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. d Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein. e Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein. f Các đáp án trên đều sai. 20 Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của: a Một bài báo trên PubMed. b Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. c Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. d Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein. e Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein. f Các đáp án trên đều sai. 21 Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của: a Một bài báo trên PubMed. b Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. c Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. d Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein. e Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein. f Các đáp án trên đều sai. 22 Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của: a Một bài báo trên PubMed. b Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. c Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. d Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein. e Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein. f Các đáp án trên đều sai. 23 Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của: a Một bài báo trên PubMed. b Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. c Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide. d Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein. e Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein. f Các đáp án trên đều sai. 24 Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 0.5 – 1.5A có ý nghĩa thế nào? a Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử. b Cấu trúc hầu như hoàn hảo, không có sai sót. c Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein. d Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót. 25 Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 1.5 – 2.0A có ý nghĩa thế nào? a Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử. b Cấu trúc hầu như hoàn hảo, không có sai sót. c Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein. d Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót. 26 Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 2.0 – 2.5A có ý nghĩa thế nào? a Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót. b Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót. c Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc. d Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein. 27 Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 2.5 – 3.0A có ý nghĩa thế nào? a Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein. b Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót. c Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc. d Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót. 28 Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 3.0 – 4.0A có ý nghĩa thế nào? a Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử. b Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót. c Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót. d Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc. 29 Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải lớn hơn 4.0A có ý nghĩa thế nào? a Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử. b Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót. c Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót. d Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc. 30 Các thông tin ta có thể xem khi tìm kiếm cấu trúc protein bằng Entrez Structure: a Tác giả bài báo công bố cấu trúc. b Phương pháp xác định cấu trúc. c Độ phân giải cấu trúc. d Tất cả đều đúng. 31 Tính năng nổi bật trong iCn3D: Choose one or more answers a Tính năng xem đồng thời cấu trúc 3D, tương tác 2D, trình tự 1D và chú giải. b Tính năng chia sẻ liên kết. c Tính năng chú giải và tùy chỉnh các track. d Tính năng trực quan hóa sắp gióng trình tự - cấu trúc. e Tính năng trực quan hóa sắp gióng cấu trúc - trình tự. f Tính năng trực quan hóa sắp gióng cấu trúc - cấu trúc. 32 Trong hình ảnh cấu trúc phân tử trên iCn3D, "các hình tròn thể hiện cho các ___, các hình vuông đại diện cho các trình tự nucleotide, còn các hình thoi đại diện cho các chất hóa học khác". Điền vào "___" cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, không cần viết hoa, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 33 Có mấy cách để sắp gióng trình tự với cấu trúc? Lưu ý: trả lời bằng một số, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 34 Chương trình Blastn có chức năng: a Tìm trình tự protein tương đồng với protein nhập vào. b Tìm trình tự protein tương đồng với nucleic acid nhập vào. c Tìm trình tự nucleic acid tương đồng với protein nhập vào. d Tìm trình tự nucleic acid tương đồng với nucleic acid nhập vào. 35 Ý nào đúng khi nói về các thông số của Nucleotide BLAST: Choose one or more answers a E value là khả năng không ngẫu nhiên tìm thấy một kết quả với số điểm tương ứng trong cơ sở dữ liệu với kích thước tương ứng. b Max ident: mức độ bao phủ của vùng trình tự gốc và trình tự tương đồng. c Identities: Đây là giá trị được sử dụng nhiểu nhất để đánh giá độ tương đồng của các trình tự. d Description: mô tả cấu trúc 3D của trình tự. 36 Chức năng reverse and complement sẽ chuyển đổi trình tự 5’ –AAATTTCCCAAAGGG-3’ thành trình tự nào sau đây: a 5’ -CCCTTTCCCTTTTTT-3’ b 5’ -CCCAAAGGGAAATTT-3’ c 5’-CCCTTTGGGAAATTT-3’ d 5’ -TTTAAAGGGTTTCCC-3’ 37 Thao tác nào sau đây là thao tác nhập dữ liệu vào chương trình AnnHyb: Choose one or more answers a Sequence -> New sequence b Sequence -> Add new sequence to project c Sequence -> Import sequence from server d Sequence -> Export sequence 38 Chọn câu đúng: Choose one or more answers a Thao tác Sequence -> Tools -> Translate để dịch mã trình tự được gọi ra. b Chương trình Blastn có chức năng tìm trình tự protein tương đồng với protein nhập vào. c Độ phân giải 2.0 – 2.5A của cấu trúc protein có thể giúp ta xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc tuy nhiên vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót. d Khi tìm khung đọc mở ta có thể chọn ba hay sáu khung đọc. e Cơ sở dữ liệu Molecular Modelling Database (MMDB) là một tập con của cơ sở dữ liệu RCSB Protein Data Bank PDB. f Khi truy cập cơ sở dữ liệu cấu trúc trên DDBJ, mỗi cấu trúc sẽ có hai mã số ID là mã số MMDB và PDB. 39 Chương trình ClustalX thực hiện sắp gióng cột các trình tự qua mấy bước cơ bản? Lưu ý: trả lời bằng một số, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 40 File kết quả sắp gióng cột (Output Alignment Files) có tên file giống như tên của file mở ban đầu, đuôi file là: a .dnd b .fasta c .aln d .txt 41 File kết quả để đọc cây hướng dẫn (Output Guide Tree) có tên file giống như tên của file mở ban đầu, đuôi file là: a .dnd b .fasta c .aln d .txt 42 Để nhập dữ liệu trình tự cho chương trình ClustalX, ta thực hiện các bước nào (nếu muốn chèn nhiều trình tự từ các file khác nhau)? Choose one or more answers a Mở chương trình - Chọn chức năng Mode: Multiple Alignment Mode – Từ menu File (chọn Load Sequences) - Nhấn nút Open. b Mở chương trình - Chọn chức năng Mode: Multiple Alignment Mode – Từ menu File (chọn Append Sequences) - Nhấn nút Open. c Mở chương trình – Từ menu File (chọn Append Sequences) - Nhấn nút Open. d Mở chương trình – Từ menu File (chọn Load Sequences) - Nhấn nút Open. 43 ClustalX là: a Một phần mềm đồ họa giúp thực hiện các thao tác chỉnh sửa và phân tích trên các trình tự DNA hay trình tự protein. b Một phần mềm miễn phí dùng để phân tích trình tự nucleotide với các đặc trưng như dịch mã, khung đọc mở,… c Một chương trình thực hiện so sánh trình tự DNA hay protein nhập vào với những trình tự có trong các cơ sở dữ liệu (GenBank, EMBL…) và lựa chọn các trình tự có mức độ tương đồng từ cao đến thấp. d Một phần mềm dùng để so sánh trình tự tương đồng nhiều trình tự DNA hay trình tự protein. 44 Khi sử dụng chương trình BioEdit để xem kết quả xếp gióng cột từ chương trình ClustalX, cần chọn file kết quả có đuôi file nào? a .txt b .dnd c .aln d .fasta 45 Các trình tự đại phân tử phản ánh sự đa dạng sinh học, thích hợp cho nghiên cứu tiến hóa vẫn đang được khảo sát. Đối với các sinh vật có mối quan hệ tiến hóa gần, phân tử nào là thích hợp? a DNA ti thể b RNA ribosome c SSU rRNA d Cả A, B đều đúng 46 Các trình tự đại phân tử phản ánh sự đa dạng sinh học, thích hợp cho nghiên cứu tiến hóa vẫn đang được khảo sát. Đối với các sinh vật có mối quan hệ tiến hóa xa hơn, phân tử nào là thích hợp? Choose one or more answers a DNA ti thể b RNA ribosome c SSU rRNA d Protein 47 Trong các dạng cây phát sinh loài dưới đây, dạng nào xem được khoảng cách giữa các loài? Choose one or more answers a Cladogram b Radial tree c Rectanglar Cladogram d Phylogram 48 Hình bên là hình ảnh của dạng cây phát sinh loài nào? a Cladogram b Radial tree c Rectanglar Cladogram d Phylogram 49 Hình bên là hình ảnh của dạng cây phát sinh loài nào? a Cladogram b Radial tree c Rectanglar Cladogram d Phylogram 50 Hình bên là hình ảnh của dạng cây phát sinh loài nào? a Cladogram b Radial tree c Rectanglar Cladogram d Phylogram 51 Hình bên là hình ảnh của dạng cây phát sinh loài nào? a Cladogram b Radial tree c Rectanglar Cladogram d Phylogram 52 Chức năng của reverse and complement là gì : a Chỉnh sửa và phân tích trên các trình tự DNA hay trình tự protein. b Chuyển đổi trình tự cần phân tích thành trình tự ngược chiều và bổ sung với trình tự ban đầu. c So sánh tương đồng nhiều trình tự DNA hay trình tự protein. d Xây dựng cây hướng dẫn dựa vào điểm tương đồng của các cặp trình tự. 53 "Nguyên tắc tìm kiếm khung đọc mở ORF là dò tìm dọc theo trình tự DNA từng cụm bộ ba liên tục để xác định sự tồn tại của một bộ ba ___ và một bộ ba ___". Điền vào "___" thứ hai cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, không cần viết hoa, không cần chấm câu; giữa các từ phân cách với nhau bằng một khoảng trắng, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 54 Chọn ý sai: Choose one or more answers a AnnHyb là phần mềm miễn phí dùng để phân tích trình tự nucleotide. b iCn3D cho phép lưu lại hình ảnh cấu trúc protein và chia sẻ nó với người khác. c Enzyme cắt giới hạn là enzyme của người, có chức năng cắt DNA ở những vị trí chuyên biệt. d Sắp gióng cột nhiều trình tự mô tả mối quan hệ giữa hai hay nhiều trình tự trong cùng một họ chức năng. e Nguyên tắc tính (dự đoán) nhiệt độ nóng chảy của mồi có thể được tính theo 3 cách. f Ta có thể kiểm tra tính duy nhất và đặc hiệu của mồi bằng công cụ Blast trên NCBI. 55 Chọn ý sai: Choose one or more answers a Pair Any: Khả năng bắt cặp để tạo thành cấu trúc thứ cấp của mồi. b Dữ liệu được xử lí trong phần mềm AnnHyb là các trình tự DNA. c Khi tìm kiếm trình tự trên trình tự gốc bằng Search for sub-sequence thì cập nhập vào trình tự có tối thiểu 4 nucleotide d Translate sequence cho phép dịch mã theo sáu khung đọc khác nhau. e Trong AnnHyb các trình tự có thể xuất ra dưới các định dạng Genbank, EMBL, FASTA, HTML . f Thành phần base của mồi: thường ưu tiên cho thành phần mồi ngẫu nhiên, tốt hơn hết là tổng (G+C) khoảng 60 - 70%, tránh trình tự mồi với (A+T) dài và nên giàu (G+C). 56 "Đoạn mồi được sử dụng trong phản ứng PCR được thiết kế dựa vào hai vùng trình tự đã được biết, nằm ở hai đầu của đoạn ___ cần khuếch đại". Điền vào "___" cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, không cần viết hoa, không cần chấm câu; giữa các từ phân cách với nhau bằng một khoảng trắng, không thêm khoảng trắng thừa. Written answer 57 Chọn ý đúng: Choose one or more answers a Nhiệt độ nóng chảy của mồi nằm trong giới hạn 52 °C - 65 °C. b Bản đồ enzyme cắt giới hạn là bản đồ các vị trí cắt giới hạn trên vùng tương đồng của bộ gen. c Global alignment sắp gióng cột hai trình tự nhằm tìm ra vùng tương đồng nhất. d Tính duy nhất đảm bảo vị trí bắt cặp là duy nhất trên toàn bộ trình tự bản mẫu. e Sau khi thiết kế xong mồi thì cần kiểm tra tính duy nhất và đặc hiệu của mồi để có được một cặp mồi khả dụng cho phản ứng PCR. f Độ phân giải cấu trúc của protein từ 1.0 - 1.8 nghĩa là cấu trúc protein này hầu như hoàn hảo.

1

NCBI là viết tắt của:

a

National Center for Biotechnology Information

b

Nation Center for Biotechnology Information

c

National Center for Biology Information

d

Nation Center for Biology Information

2

NCBI là viết tắt của:

a

Nation Center for Biotechnology Information

b

Nation Center for Biotechnology Information

c

National Center for Biology Information

d

National Center for Biotechnology Information

3

Đâu là cơ sở dữ liệu thuộc NCBI?

Choose one or more answers

a

Bookshelf

b

OMIM (Online Medelian Inheritance in Man

c

dbEST (Database of Expressed Sequence Tags)

d

GermOnLine

e

Structure (Molecular Modeling Database)

f

Assembly

4

Đâu là cơ sở dữ liệu thuộc NCBI?

Choose one or more answers

a

BLAST

b

PROSITE

c

PopSet Database

d

Protein Database

e

Database

f

ENZYME

5

Đâu là cơ sở dữ liệu thuộc NCBI?

Choose one or more answers

a

HomoloGene

b

Copernic

c

dbVar (Database of Genomic Structural Variation)

d

Entrez

e

dbSNP (Database of Short Genetic Vairiations)

f

iCn3D

6

Đâu là trang web giúp ta có thể tra cứu những thông tin về sinh học?

Choose one or more answers

a

http://www.ncbi.nlm.nil.gov/

b

http://www.ncbi.nlm.gov/search/

c

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/

d

http://www.ebi.ac.uk/

e

http://www.ioit-hcm.ac.vn

f

https://www.ebi.ac.uk/about/news

7

Đâu là trang web có thể giúp ta tra cứu những thông tin về sinh học?

Choose one or more answers

a

https://www.ebi.ac.uk/about

b

https://en.wikipedia.org/wiki/Main_Page

c

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.go/

d

http://www.expasy.org/

e

https://www.expasy/structural_bioinformatics

f

https://www.expasy.org/genomics

8

Đâu là trang web có thể giúp ta tra cứu những thông tin về sinh học?

Choose one or more answers

a

https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html

b

https://www.epasy.org/

c

https://www.ddbj.nig.ac.jp/services-e.html

d

https://www.rcsb.org/

e

http://www.ncbi.nlm.nil.gov/Genbank/

f

https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/

9

Đâu là tên của một ngân hàng dữ liệu sinh học?

Choose one or more answers

a

EMBL-EBI

b

ExPASy

c

CMBS

d

SCOP

e

Prosite

f

Pfam

10

Sơ đồ nguyên tắc tìm kiếm thường sử dụng là:

a

Chọn cách tìm kiếm > Xác định từ khóa > Thông tin cần tìm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm

b

Xác định từ khóa > Chọn cách tìm kiếm > Thông tin cần tìm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm

c

Thông tin cần tìm > Xác định từ khóa > Chọn cách tìm kiếm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm

d

Chọn cách tìm kiếm > Xác định thông tin > Từ khóa cần tìm > Lọc thông tin > Kết quả cần tim

11

Sơ đồ nguyên tắc tìm kiếm thường sử dụng là:

a

Thông tin cần tìm > Chọn cách tìm kiếm > Xác định kết quả > Lọc thông tin > Kết quả cần tim

b

Thông tin cần tìm > Xác định thông tin > Chọn cách tìm kiếm > Lọc kết quả > Kết quả cần tìm

c

Thông tin cần tìm > Xác định thông tin > Chọn trang tìm kiếm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm

d

Thông tin cần tìm > Xác định từ khóa > Chọn cách tìm kiếm > Lọc thông tin > Kết quả cần tìm

12

Nguyên tắc chung của việc nhập từ khóa là:

Choose one or more answers

a

Để tìm thông tin có nhiều từ khóa ta nhập tuần tự các từ khóa và phân cách giữa các từ bằng khoảng trắng (dùng spacebar).

b

Để tìm kiếm thông tin có ít từ khóa ta cần nhập tất cả các từ khóa vào trong ô tìm kiếm, phân cách giữa các từ bằng dấu "+".

c

Để tìm thông tin chứa một cụm từ khóa ta thường đặt chúng trong dấu ngoặc kép (""), các từ ít liên quan (for, of, in, to,...) cũng phải được nhập vào để đảm bảo độ chính xác của kết quả.

d

Để tìm thông tin chứa một cụm từ khóa ta thường đặt chúng trong dấu ngoặc vuông (""), các từ thường dùng có thể lược bỏ.

e

Để tìm thông tin chứa một cụm từ khóa ta thường đặt chúng trong dấu ngoặc kép (""), các từ thường dùng (for, of, in, to,...) có thể lược bỏ.

13

"_ là hệ thống tìm kiếm và truy cập chính của NCBI". Điền vào "_" cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, viết hoa chữ cái đầu câu, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

14

Có mấy cách để truy cập vào trang Entrez? Lưu ý: trả lời bằng một số, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

15

"Trong Entrez, bạn có thể tìm kiếm nhiều dạng cơ sở dữ liệu khác nhau. Mỗi cơ sở dữ liệu là một liên kết được biểu thị bằng dòng văn bản màu _. Các dòng văn bản này sẽ đổi màu khi được chọn". Điền vào "_" cho thích hợp:

a

vàng

b

xanh

c

nâu

d

đen

16

"_ của công trình trên NCBI, là một dãy số đặc trưng duy nhất cho mỗi bài báo công bố được lưu trữ trên NCBI". Điền vào "_" cho phù hợp. Lưu ý: Lưu ý: viết đúng chính tả, kể cả các chữ viết in hoa, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

17

Để thu hẹp phạm vi tìm kiếm bài báo trên cơ sở dữ liệu PubMed ta có thể dùng:

Choose one or more answers

a

Các mục chức năng phía trái của kết quả tìm kiếm như: Article type, Text avaibility, Publication dates, Species.

b

Tùy chỉnh kết quả hiển thị thông qua thay đổi định dạng (Format) hoặc thứ tự sắp xếp (Sort by).

c

Thẻ tag (ví dụ: [AB], [AU], [DP], [CY], [IP], [IS], [LA], [PG], [TI], [VI], [JO]).

d

Tìm kiếm với từ khóa là cụm từ (phrase).

e

Sử dụng các toán tử so sánh boolean [AND, OR, NOT].

18

Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của:

a

Một bài báo trên PubMed.

b

Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

c

Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

d

Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein.

e

Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein.

f

Các đáp án trên đều sai.

19

Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của:

a

Một bài báo trên PubMed.

b

Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

c

Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

d

Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein.

e

Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein.

f

Các đáp án trên đều sai.

20

Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của:

a

Một bài báo trên PubMed.

b

Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

c

Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

d

Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein.

e

Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein.

f

Các đáp án trên đều sai.

21

Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của:

a

Một bài báo trên PubMed.

b

Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

c

Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

d

Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein.

e

Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein.

f

Các đáp án trên đều sai.

22

Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của:

a

Một bài báo trên PubMed.

b

Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

c

Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

d

Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein.

e

Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein.

f

Các đáp án trên đều sai.

23

Sau khi thực hiện tìm kiếm, kết quả trên hình là giao diện của:

a

Một bài báo trên PubMed.

b

Các trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

c

Một trình tự nucleotide trong cơ sở dữ liệu Nucleotide.

d

Các trình tự protein trong trong cơ sở dữ liệu Protein.

e

Một trình tự protein trong cơ sở dữ liệu protein.

f

Các đáp án trên đều sai.

24

Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 0.5 – 1.5A có ý nghĩa thế nào?

a

Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử.

b

Cấu trúc hầu như hoàn hảo, không có sai sót.

c

Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein.

d

Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót.

25

Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 1.5 – 2.0A có ý nghĩa thế nào?

a

Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử.

b

Cấu trúc hầu như hoàn hảo, không có sai sót.

c

Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein.

d

Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót.

26

Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 2.0 – 2.5A có ý nghĩa thế nào?

a

Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót.

b

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót.

c

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc.

d

Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein.

27

Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 2.5 – 3.0A có ý nghĩa thế nào?

a

Cấu trúc ít có sai sót, kể cả phần các cấu trúc vòng loop trên bề mặt protein.

b

Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót.

c

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc.

d

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót.

28

Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải 3.0 – 4.0A có ý nghĩa thế nào?

a

Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử.

b

Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót.

c

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót.

d

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc.

29

Độ phân giải là đơn vị thể hiện độ rõ của bản đồ mật độ của electron bên trong tinh thể đại phân tử. Độ phân giải lớn hơn 4.0A có ý nghĩa thế nào?

a

Chỉ xác định được sơ nét cấu trúc bậc 2 của phân tử.

b

Xác định được các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên của amino acid có thể sai sót.

c

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc. Vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót.

d

Xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc và vị trí của các nhánh bên, có thể xác định được các phân tử nước và các ligand nhỏ liên kết với đại phân tử trong cấu trúc.

30

Các thông tin ta có thể xem khi tìm kiếm cấu trúc protein bằng Entrez Structure:

a

Tác giả bài báo công bố cấu trúc.

b

Phương pháp xác định cấu trúc.

c

Độ phân giải cấu trúc.

d

Tất cả đều đúng.

31

Tính năng nổi bật trong iCn3D:

Choose one or more answers

a

Tính năng xem đồng thời cấu trúc 3D, tương tác 2D, trình tự 1D và chú giải.

b

Tính năng chia sẻ liên kết.

c

Tính năng chú giải và tùy chỉnh các track.

d

Tính năng trực quan hóa sắp gióng trình tự - cấu trúc.

e

Tính năng trực quan hóa sắp gióng cấu trúc - trình tự.

f

Tính năng trực quan hóa sắp gióng cấu trúc - cấu trúc.

32

Trong hình ảnh cấu trúc phân tử trên iCn3D, "các hình tròn thể hiện cho các _, các hình vuông đại diện cho các trình tự nucleotide, còn các hình thoi đại diện cho các chất hóa học khác". Điền vào "_" cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, không cần viết hoa, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

33

Có mấy cách để sắp gióng trình tự với cấu trúc? Lưu ý: trả lời bằng một số, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

34

Chương trình Blastn có chức năng:

a

Choose one or more answers

a

Sequence -> New sequence

b

Sequence -> Add new sequence to project

c

Sequence -> Import sequence from server

d

Sequence -> Export sequence

38

Chọn câu đúng:

Choose one or more answers

a

Thao tác Sequence -> Tools -> Translate để dịch mã trình tự được gọi ra.

b

Chương trình Blastn có chức năng tìm trình tự protein tương đồng với protein nhập vào.

c

Độ phân giải 2.0 – 2.5A của cấu trúc protein có thể giúp ta xác định được tốt các gấp cuộn của cấu trúc tuy nhiên vị trí các nhánh bên nhỏ hoặc các nhánh bên dài, mỏng trên amino acid có thể có sai sót.

d

Khi tìm khung đọc mở ta có thể chọn ba hay sáu khung đọc.

e

Cơ sở dữ liệu Molecular Modelling Database (MMDB) là một tập con của cơ sở dữ liệu RCSB Protein Data Bank PDB.

f

Khi truy cập cơ sở dữ liệu cấu trúc trên DDBJ, mỗi cấu trúc sẽ có hai mã số ID là mã số MMDB và PDB.

39

Chương trình ClustalX thực hiện sắp gióng cột các trình tự qua mấy bước cơ bản? Lưu ý: trả lời bằng một số, không cần chấm câu, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

40

File kết quả sắp gióng cột (Output Alignment Files) có tên file giống như tên của file mở ban đầu, đuôi file là:

a

.dnd

b

.fasta

c

.aln

d

.txt

41

File kết quả để đọc cây hướng dẫn (Output Guide Tree) có tên file giống như tên của file mở ban đầu, đuôi file là:

a

a

Chỉnh sửa và phân tích trên các trình tự DNA hay trình tự protein.

b

Chuyển đổi trình tự cần phân tích thành trình tự ngược chiều và bổ sung với trình tự ban đầu.

c

So sánh tương đồng nhiều trình tự DNA hay trình tự protein.

d

Xây dựng cây hướng dẫn dựa vào điểm tương đồng của các cặp trình tự.

53

"Nguyên tắc tìm kiếm khung đọc mở ORF là dò tìm dọc theo trình tự DNA từng cụm bộ ba liên tục để xác định sự tồn tại của một bộ ba _ và một bộ ba _". Điền vào "___" thứ hai cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, không cần viết hoa, không cần chấm câu; giữa các từ phân cách với nhau bằng một khoảng trắng, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

54

Chọn ý sai:

Choose one or more answers

a

AnnHyb là phần mềm miễn phí dùng để phân tích trình tự nucleotide.

b

iCn3D cho phép lưu lại hình ảnh cấu trúc protein và chia sẻ nó với người khác.

c

Enzyme cắt giới hạn là enzyme của người, có chức năng cắt DNA ở những vị trí chuyên biệt.

d

Sắp gióng cột nhiều trình tự mô tả mối quan hệ giữa hai hay nhiều trình tự trong cùng một họ chức năng.

e

Nguyên tắc tính (dự đoán) nhiệt độ nóng chảy của mồi có thể được tính theo 3 cách.

f

Ta có thể kiểm tra tính duy nhất và đặc hiệu của mồi bằng công cụ Blast trên NCBI.

55

Chọn ý sai:

Choose one or more answers

a

Pair Any: Khả năng bắt cặp để tạo thành cấu trúc thứ cấp của mồi.

b

Dữ liệu được xử lí trong phần mềm AnnHyb là các trình tự DNA.

c

Khi tìm kiếm trình tự trên trình tự gốc bằng Search for sub-sequence thì cập nhập vào trình tự có tối thiểu 4 nucleotide

d

Translate sequence cho phép dịch mã theo sáu khung đọc khác nhau.

e

Trong AnnHyb các trình tự có thể xuất ra dưới các định dạng Genbank, EMBL, FASTA, HTML .

f

Thành phần base của mồi: thường ưu tiên cho thành phần mồi ngẫu nhiên, tốt hơn hết là tổng (G+C) khoảng 60 - 70%, tránh trình tự mồi với (A+T) dài và nên giàu (G+C).

56

"Đoạn mồi được sử dụng trong phản ứng PCR được thiết kế dựa vào hai vùng trình tự đã được biết, nằm ở hai đầu của đoạn _ cần khuếch đại". Điền vào "_" cho phù hợp. Lưu ý: viết đúng chính tả, không cần viết hoa, không cần chấm câu; giữa các từ phân cách với nhau bằng một khoảng trắng, không thêm khoảng trắng thừa.

Written answer

57

Chọn ý đúng:

Choose one or more answers

a

Nhiệt độ nóng chảy của mồi nằm trong giới hạn 52 °C - 65 °C.

b

Bản đồ enzyme cắt giới hạn là bản đồ các vị trí cắt giới hạn trên vùng tương đồng của bộ gen.

c

Global alignment sắp gióng cột hai trình tự nhằm tìm ra vùng tương đồng nhất.

d

Tính duy nhất đảm bảo vị trí bắt cặp là duy nhất trên toàn bộ trình tự bản mẫu.

e

Sau khi thiết kế xong mồi thì cần kiểm tra tính duy nhất và đặc hiệu của mồi để có được một cặp mồi khả dụng cho phản ứng PCR.

f

Độ phân giải cấu trúc của protein từ 1.0 - 1.8 nghĩa là cấu trúc protein này hầu như hoàn hảo.

CTTN "Cùng vui học tốt" - Quiz 6

Quiz

Download the paper version to play

Created by

Top 10 results

Top Games

Quiz

Photosynthesis vs Cellular Respiration - Practice Quiz

Quiz

Spanish Alphabet Listening

Quiz

Tissues - Practice Quiz

Quiz

Practice Quiz - Punnett Square, Variation, and Mutations

Quiz

UPS 5 Seeing Habits Quiz